Al realizar procesos en lo que se utilizan número aleatorios es una buena práctica fijar la semilla utilizada para garantizar que se puedan reproducir los resultados. En R esto se suele realizar mediante la instrucción set.seed()
. Una alternativa a esta práctica puede ser guardar la semilla empleada antes de inicial el proceso y posteriormente recuperarla cuando sea necesario reproducirlo. El valor de la semilla que empleará R para la generación del siguiente número aleatorio se encuentra almacenado en la variable de entorno .Random.seed
.
Planteamiento del problema
El procedimiento que se ha de utilizar para recuperar las simulaciones es bastante sencillo, antes de lanzar un proceso en el que se utilicen número aleatorios (generado por el generador de R) se carga en un variable el estado del generador de números aleatorios. En el caso de que sea necesario reproducir los resultados se puede recuperar el estado volviendo a asignar el estado guardado en la variable de entorno.
A modo de ejemplo se ruede realizar una simulación simple. Se pueden generar 100 número aleatorios, sumar su valor y repetir el proceso varias veces con diferentes semillas, esto se puede hacer con siguiente código:
total <- rep(NA, 25) seeds <- list(NULL) for(i in 1:25) { seeds <- .Random.seed total <- sum(sum(runif(100))) }
En el código se generan 25 veces 10 número aleatorios que se guardan en el vector total
, por otro lado, las semillas se guardan en la lista seeds
. Ahora para comprobar que se pueden reproducir los resultados simplemente se ha de volver a simular con la semilla adecuada. Esto se puede comprobar con el código:
for(i in 25:1) { .Random.seed <- seeds[[i]] stopifnot(total[i] == sum(sum(runif(100)))) }
Al ejecutar estas líneas en el caso de que no se cumplan las igualdades la función stopifnot()
detendría la ejecución del programa mediante una llamada a la función stop()
, cosa que no sucede. Lo que sí sucede por ejemplo en el siguiente caso:
stopifnot(total[1] == sum(sum(runif(100))))
En donde se genera el siguiente error:
Error: total[1] == sum(sum(runif(100))) is not TRUE
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